微生物污染－新冠狀病毒
[ 發(fā)表日期：2020-04-14 ]
微生物污染－新冠狀病毒
一、 病原學(xué)
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新冠狀病毒屬于套式病毒目、新冠狀病毒科、新冠狀病毒屬，是一類具有囊膜、基因組為線性單股正鏈的RNA病毒，是自然界廣泛存在的一大類病毒。病毒基因組5′端具有甲基化的帽狀結(jié)構(gòu)，3′端具有poly(A)尾，基因組全長(zhǎng)約27-32kb，是目前已知RNA病毒中基因組最大的病毒[1]。新冠狀病毒僅感染脊椎動(dòng)物，與人和動(dòng)物的多種疾病有關(guān)，可引起人和動(dòng)物呼吸道、消化道和神經(jīng)系統(tǒng)疾病[2]。
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根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育樹，新冠狀病毒可分為四個(gè)屬：α、β、γ、δ，其中β屬新冠狀病毒又可分為四個(gè)獨(dú)立的亞群A、B、C和D群[3]。
1.可感染人的新冠狀病毒。迄今為止，除本次在武漢引起病毒性肺炎暴發(fā)疫情的新的新冠狀病毒外，共發(fā)現(xiàn)6種可感染人類的新冠狀病毒（HCoV-229E、HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-NL63、HCoV-HKU1 和MERS-CoV）。HCoV-229E 和HCoV-NL63屬于α屬新冠狀病毒，HCoV-OC43、SARS-CoV、HCoV-HKU1 和MERS-CoV均為β屬新冠狀病毒，其中，HCoV-OC43 和HCoV-HKU1 屬于A亞群，SARS-CoV 屬于B亞群，MERS-CoV屬于C亞群（見(jiàn)圖1）。
2.動(dòng)物新冠狀病毒。包括哺乳動(dòng)物新冠狀病毒和禽新冠狀病毒。哺乳動(dòng)物新冠狀病毒主要為α、β屬新冠狀病毒，可感染包括豬、犬、貓、鼠、牛、馬等多種動(dòng)物。禽新冠狀病毒主要來(lái)源于γ、δ屬新冠狀病毒，可引起多種禽鳥類如雞、火雞、麻雀、鴨、鵝、鴿子等發(fā)病[4]。
（三）理化特性
人新冠狀病毒對(duì)熱較為敏感，病毒在4℃合適維持液中為中等穩(wěn)定，-60℃可保存數(shù)年，但隨著溫度的升高，病毒的抵抗力下降，如HCoV-229E于56℃ 10分鐘或者37℃數(shù)小時(shí)即可使喪失感染性， SARS-CoV于37℃可存活4天，56℃加熱90分鐘、75℃加熱30分鐘能夠滅活病毒。
人新冠狀病毒不耐酸不耐堿，病毒復(fù)制的最適宜PH值為7.2。
人新冠狀病毒對(duì)有機(jī)溶劑和消毒劑敏感，75%酒精、乙醚、氯仿、甲醛、含氯消毒劑、過(guò)氧乙酸和紫外線均可滅活病毒[2]。
人新冠狀病毒中SARS-CoV于室溫24℃條件下在尿液里至少可存活10天，在腹瀉病人的痰液和糞便里能存活5天以上，在血液中可存活約15天，在塑料、玻璃、馬賽克、金屬、布料、復(fù)印紙等多種物體表面均可存活2-3天[5]。
參考文獻(xiàn)
[1] Weiss S.R, S Navas-Martin. Coronavirus pathogenesis and the emerging pathogen severe acute respiratory syndrome coronavirus[J]. Microbiol Mol Biol Rev, 2005. 69(4): 635-64.
[2]劉克洲.人類病毒性疾病[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,2010:643-665.
[3]http://ictvonline.org/proposals/2008.085-122 V.v4.Coronaviridae.pdf
[4]楊揚(yáng),譚文杰.新冠狀病毒載體研究進(jìn)展[J].病毒學(xué)報(bào),2012.28(03):297-302.
[5] （傳染性非典型肺炎（SARS）診療方案（2004版））
二、臨床表現(xiàn)
常見(jiàn)的人新冠狀病毒（包括229E、NL63、OC43和HKU1型），通常會(huì)引起輕度或中度的上呼吸道疾病，如感冒。癥狀主要包括流鼻涕、頭痛、咳嗽、咽喉痛、發(fā)熱等，有時(shí)會(huì)引起肺炎或支氣管炎等下呼吸道疾病，心肺疾病患者、免疫力低下人群、嬰兒和老年人中較為常見(jiàn)。
MERS-CoV和SARS-CoV常引起較為嚴(yán)重癥狀。MERS癥狀通常包括發(fā)熱、咳嗽和呼吸急促，甚至發(fā)展為肺炎，病死率約為34.4%。SARS癥狀通常包括發(fā)熱、畏寒和身體疼痛，甚至發(fā)展為肺炎，病死率約為9.6%。
三、流行病學(xué)
人新冠狀病毒可對(duì)人造成普通感冒，嚴(yán)重急性呼吸綜合征（SARS）和中東呼吸綜合征（MERS）,在流行病學(xué)特征上存在一定差異。
在全球，10%~30%的上呼吸道感染由HCoV-229E、HCoV-OC43、HCoV-NL63和HCoV-HKU1四類新冠狀病毒引起，在造成普通感冒的病因中占第二位[1]，僅次于鼻病毒。感染呈現(xiàn)季節(jié)性流行，每年春季和冬季為疾病高發(fā)期[2]。潛伏期2-5天，人群普遍易感。主要通過(guò)人與人接觸傳播[3]。
SARS由人感染SARS-CoV引起，首先出現(xiàn)在我國(guó)廣東省部分地區(qū)，之后波及我國(guó)24個(gè)省、自治區(qū)、直轄市和全球其他28個(gè)國(guó)家和地區(qū)。2002年11月至2003年7月全球首次SARS流行中，全球共報(bào)告臨床診斷病例8096例，死亡774例，病死率9.6%。SARS的潛伏期通常限于2周之內(nèi)，一般約2～10天。人群普遍易感。SARS病人為最主要的傳染源，癥狀明顯的病人傳染性較強(qiáng)，潛伏期或治愈的病人不具備傳染性[4]。
MERS是一種由MERS-CoV引起的病毒性呼吸道疾病，于2012年在沙特阿拉伯首次得到確認(rèn)。自2012年起，MERS在全球共波及中東、亞洲、歐洲等27個(gè)國(guó)家和地區(qū)，80%的病例來(lái)自沙特阿拉伯，病死率約35%。潛伏期最長(zhǎng)為14天，人群普遍易感。單峰駱駝是MERS-CoV的一大宿主，且為人間病例的主要傳染來(lái)源，人與人之間傳播能力有限[5]。自2004年以來(lái)，全球未報(bào)告過(guò)SARS人間病例。
參考文獻(xiàn)
[1]劉克洲.人類病毒性疾病[M].北京:人民衛(wèi)生出版社,2010:643-665.
[2] YuDong Yin. MERS, SARS and other coronaviruses as causes of pneumonia[J]. Respirology, 2018,23:130–137.
[3] Shuo Su. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses[J]. Trends in Microbiology, 2016, 24(6):490-502.
[4]《SARS診療方案（2004版）》
[5] 世界衛(wèi)生組織網(wǎng)站. https://www.who.int/zh/news-room/fact-sheets/detail/middle-east-respiratory-syndrome-coronavirus-(mers-cov)
四、實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法
已知的6種可感染人類的新冠狀病毒中，中東呼吸綜合征新冠狀病毒（MERS-CoV）和嚴(yán)重急性呼吸綜合征新冠狀病毒（SARS-CoV）所致疾病的嚴(yán)重程度以及社會(huì)影響遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過(guò)其它新冠狀病毒，實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法相對(duì)較為成熟。
?。ㄒ唬┲袞|呼吸綜合征新冠狀病毒（MERS-CoV）
病原學(xué)檢查主要包括病毒分離、病毒核酸檢測(cè)。病毒分離為實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的“金標(biāo)準(zhǔn)”。病毒核酸檢測(cè)可以用于早期診斷。檢測(cè)時(shí)應(yīng)及時(shí)留取多種標(biāo)本（咽拭子、鼻拭子、鼻咽或氣管抽取物、痰或肺組織，以及血液和糞便）進(jìn)行檢測(cè)，其中以下呼吸道標(biāo)本陽(yáng)性檢出率更高。
1.病毒核酸檢測(cè)（PCR）。以RT-PCR（最好采用real-time RT-PCR）法檢測(cè)呼吸道標(biāo)本中的MERS-CoV核酸。
2.病毒分離培養(yǎng)。可從呼吸道標(biāo)本中分離出MERS-CoV,但一般在細(xì)胞中分離培養(yǎng)較為困難。
（二）嚴(yán)重急性呼吸綜合征新冠狀病毒（SARS-CoV）
1.SARS-CoV RNA檢測(cè)：SARS-CoV RNA陽(yáng)性判斷標(biāo)準(zhǔn)為PCR檢測(cè)結(jié)果符合下列三項(xiàng)之一者可判斷為陽(yáng)性。
（1）至少需要兩個(gè)不同部位的臨床標(biāo)本檢測(cè)陽(yáng)性（例如鼻咽分泌物和糞便）。
?。?）收集至少間隔2天的同一種臨床標(biāo)本送檢檢測(cè)陽(yáng)性（例如2份或多份鼻咽分泌物）。
?。?）在每一個(gè)特定檢測(cè)中對(duì)原臨床標(biāo)本使用兩種不同的方法，或從原標(biāo)本新提取RNA開始重復(fù)PCR檢測(cè)陽(yáng)性。
PCR檢測(cè)結(jié)果的確認(rèn)：①使用原始標(biāo)本重復(fù)PCR試驗(yàn)；②在第二個(gè)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)同一份標(biāo)本。
2.SARS-CoV特異性抗原N蛋白檢測(cè)：定性檢測(cè)血清或血漿標(biāo)本中SARS-CoV核衣殼(N)抗原，用于SARS-CoV感染的早期輔助診斷。
3.SARS-CoV特異性抗體檢測(cè)：特異性抗體檢測(cè)診斷SARS標(biāo)準(zhǔn)為符合以下兩者之一即可診斷為SARS。
?。?）平行檢測(cè)急性期血清抗體和恢復(fù)期血清抗體發(fā)現(xiàn)抗體陽(yáng)轉(zhuǎn)。
?。?）平行檢測(cè)急性期血清抗體和恢復(fù)期血清抗體發(fā)現(xiàn)抗體滴度升高≥4倍。